Johann Jakob Heckel nasce in Germania ed esattamente a  Mannheim il 23 gennaio del 1790. 

Non iniziò la sua vita studiando zoologia ma, come tanti ricercatori e scenziati dell’epoca, iniziò la sua opera intraprendendo viaggi di esplorazione. 

Si trasferì a Vienna dove, collaborando con altri ricercatori sul campo, come Cuvier, Valenciennes, Karl Alexander Hügel, Johannes Peter Müller, Franz Hermann Troschel, Theodor Kotschy,Joseph Russeger e altri, sviluppando una predilezione per il settore ittico e  occupandosi  della catalogazione di nuove specie che gli venivano mandate dalle raccolte sui siti di pescaggio, ricoprendo la carica di direttore del ramo ittiologico del Museo Naturhistorisches in Vienna. 

Fu interessato in attività di raccolta e studio di nuove specie in medio oriente, i cui frutti accrebbero in maniera notevole il museo naturalistico viennese. I suoi lavori portarono a notevoli risultati nella sistematica, soprattutto nei ciprinidi e dalla sua attività scaturirono più di sessanta opere, tra le quali vanno senza dubbio evidenziate: 

  • Beiträge zur kenntniss der fossilen fische Österreichs, del 1856
  • Cyprinen, Scaphirhynchus und andere ichthyologica, con Johann Natterer dal 1836 al 1840
  • Fische aus Caschmir, con Karl Alexander Hügel. Del 1838
  • Neue Beiträge zur Kenntniss der fossilen Fische Österreichs, con Rudolf Kner del 1861

 e particolarmente Die Süßwasserfische der österreichischen Monarchie, opera a cui dedicò 24 anni della sua esistenza, morendo prima del suo completamento. Muore a Vienna il primo marzo del 1857, con molte probabilità dopo essere stato infettato da batteri di una balena morta. 

Alla sua opera di  catalogazione tassonomica dobbiamo, tra le altre, specie di ciclidi come : 

  • Astronotus crassipinnis
  • Acaronia nassa
  • Aequidens diadema
  • Aequidens pallidus
  • Aequidens tetramerus
  • Aequidens viridis
  • Biotodoma cupido
  • Bujurquina vittata
  • Chaetobranchus flavescens
  • Cichlasoma dimerus
  • Crenicichla adspersa
  • Crenicichla johanna
  • Crenicichla lenti culata
  • Crenicichla lepidota
  • Crenicichla lugubris
  • Crenicichla macrophthalma
  • Crenicichla semifasciata
  • Crenicichla vittata
  • Geophagus altifrons
  • Geophagus megasema
  • Heros efasciatus
  • Heros severus
  • Heros spurius
  • Herichthys deppii
  • Hypselecara coryphaenoides
  • Hoplarchus psittacus
  • Laetacara dorsigera
  • Mesonauta festivus
  • Mesonauta insignis
  • Parachromis friedrichsthalii
  • Satanoperca acuticeps
  • Satanoperca daemon
  • Satanoperca jurupari
  • Satanoperca pappaterra
  • Symphysodon discus
  • Uaru amphiacanthoides

 In onore alla sua opera di ricercatore gli sono state dedicate specie come: 

  • Acarichthys heckelii
  • Crenicichla heckeli
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